2B尼尔机械纪元的具体结束时间没有明确的官方说明，但根据游戏情节和结局的提示，似乎可以得出一个大致时间。根据游戏剧情，2B尼尔机械纪元的主线故事情节持续时间大约在5000年左右，在这个漫长的过程中，机器族与人类族之间爆发了无数次战争和冲突，也经历了许多历史事件。

而在游戏最终结局中，随着2B、9S和艾娃等角色的牺牲，机械纪元的历史画上了句号，也为下一代的人类和机器之间的和平交流开启了新的篇章。因此，可以认为2B尼尔机械纪元的结束时间是在游戏结局发生之后。