无论是面粉厂麦麸还是自己磨的麦麸，其实并没有哪种更好，只是适用于不同的情况。面粉厂麦麸产量大，而且挑选和处理都比较规范，因此质量相对比较稳定，适合需要大量生产的企业或个人使用。

而自己磨麦麸既保证了原料的新鲜度和营养成分的完整性，又可以根据自己的需求进行合理搭配，适合家庭自用或者小规模生产。总之，根据自身需求做出选择才是最重要的。