超过两年执行时效未申请强制执行判决书不是废纸。
一般来说，人民法院的民事判决书在两年内未申请强制执行，并不意味着判决书失效或成为废纸。超过两年执行时效未申请强制执行的判决书，在没有特殊情况下是不能再申请人民法院强制执行的。但是，如果有特殊原因，例如家庭困难等，经过院长签字同意，仍然可以申请强制执行。
此外，根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十九条的规定，申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。前款规定的期间，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从规定的每次履行期间的最后一日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。因此，超过两年执行时效未申请强制执行的判决书并非废纸，而是仍有法律效力。