青岛方特1号航站楼和2号航站楼的主要区别在于它们提供的游乐项目不同。1号航站楼主要是飞越恐龙岛，让游客领略恐龙的世界。而2号航站楼则提供飞越极限经典项目，让游客浏览祖国的大好河山，体验非常壮观。值得注意的是，游客在体验完1号航站楼的项目后，如果想体验2号航站楼的项目，需要重新排队，而且座位不能选择，但中间的座位体验感最好。此外，2号航站楼还有一个适合小朋友的电子射击类游戏小鸡不好惹，以及一个有时间定点演出的项目水漫金山，讲述的是白娘子和许仙的故事，分为室外和室内两部分。