被执行人变成空壳公司后，执行程序会受到一定的影响，但并不意味着无法执行。以下是一些应对措施：

1.调查核实：在执行程序中，应该对被执行人的财务状况进行调查核实，验证是否存在财产、资产等，并获取证据。

2.申请股权冻结：如果被执行人是一个公司，且还有其他股东或合伙人，可以申请对被执行人的股权进行冻结，这样可以防止被执行人将财产转移至其他公司或个人名下。

3.申请查封财产：执行程序可以申请对被执行人名下的财产进行查封，防止财产被转移、变卖或者毁损。

4.申请破产清算：如果被执行人是一个公司，且该公司已经无法清偿债务，可以申请破产清算，清算公司的财产以弥补债务。

总的来说，即使被执行人变成了空壳公司，执行程序也并非无法进行，可以通过以上措施来保障执行程序不受影响。但需要注意，在执行程序中要遵守法律程序和程序规定，避免违反法律规定导致执行程序被驳回。