小规模企业财务报表网上申报的流程可以大致分为以下几个步骤：

1. 准备好需要申报的财务报表，包括资产负债表、利润表等。

2. 根据财务报表填写相应的税表（如增值税和所得税），并生成电子申报表。

3. 登录国家税务总局网站或地方税务局网站，在“网上申报”页面选择相应的税种和表格，上传电子申报表，确认无误后提交申报。

4. 在线缴纳相应的税款，或者选择延期缴纳、减免等方式。