员工自动离职补偿标准是按照劳动者工作年限来支付经济补偿金，也就是劳动者在本单位工作的时间，满一年的就按照一个月的本人工资来进行年发放，如果说没有达到一年的时间，但是年满6个月了，就是按照一个月计算。