《药屋少女的呢喃》是一部漫画作品，其中男主角最后毁容的原因是由于他被卷入了一场火灾事故。

在故事的情节中，男主角在保护女主角和其他人的过程中，不幸被火焰烧伤，导致他的脸部和其他部位受到了严重的伤害。虽然他最终幸存下来，但是他的容貌却被毁掉了，需要进行长期的康复和治疗。

这个情节是故事情节的一部分，旨在展示男主角的勇敢和无私，同时也反映了火灾事故对个人和社会可能带来的严重后果。漫画通过这个情节，呼吁人们关注火灾安全，珍惜生命和身边的人。