东南大学与华东地区的五个知名高校（如复旦大学、上海交通大学等）在整体实力和声誉上存在一定差距。

一般来说，复旦大学、上海交通大学等名校在国内及国际上享有较高的声誉，拥有更为优秀的师资力量、研究资源、学术氛围和学术成果。

相比之下，东南大学在某些方面可能存在一定的差距，如综合实力、科研水平、学术影响力等方面。然而，各个学校都有自己的特色和优势，选择学校应该根据个人的兴趣、专业需求和未来规划来考量。希望这个回答能为您提供参考。如果您有任何其他问题，请随时告诉我。