要确定72V 250A锂电池和5000W电机应该搭配多大的电机控制器，必须考虑一些因素：

1. 电机的额定电流：必须选择与电机额定电流相匹配的控制器来确保电机能够正常工作。

2. 电机的额定功率：必须选择具有足够功率的控制器来支持电机的额定功率。

3. 峰值电流：电机启动时可能需要更高的电流，因此控制器还需要具有适当的峰值电流，以支持电机的起动。