区别主要在于覆盖范围和报销比例。

亲青保是指由中国青年政治学院创办的一种保险，主要面向青年学生和社会人士，覆盖范围包括小病小伤、门诊、住院等，报销比例在50%以上。

而琴岛医保是指由福建省福建医科大学琴岛医院主办的医保，主要面向琴岛医院的患者和居民，覆盖范围包括各种医疗服务，报销比例在80%以上。