在鱼检疫中，应该使用亚甲基蓝而不是高锰酸钾。亚甲基蓝可以有效地检测到细菌和寄生虫的存在，而高锰酸钾只能检测到水中的有机物。此外，高锰酸钾还有可能对鱼类造成伤害，而亚甲基蓝对鱼类影响较小。因此，为了确保鱼类的健康和安全，检测时应该使用亚甲基蓝。