投诉自来水公司的方式有拨打12345市长热线，该热线可转接水务主管部门；拨打当地自来水（水务）公司客服电话；拨打当地住建委监察电话。无法解决或无故拖延解决，可找电视台等媒体。
法律依据
《水污染防治法》第三条
水污染防治应当坚持预防为主、防治结合、综合治理的原则，优先保护饮用水水源，严格控制工业污染、城镇生活污染，防治农业面源污染，积极推进生态治理工程建设，预防、控制和减少水环境污染和生态破坏。
《水污染防治法》第四条
县级以上人民政府应当将水环境保护工作纳入国民经济和社会发展规划。
地方各级人民政府对本行政区域的水环境质量负责，应当及时采取措施防治水污染。