芒种杯和绿书签都是倡导阅读的活动，但两者的组织单位、目的和形式等方面存在差异，具体区别如下：

- 芒种杯：是由沈阳市委宣传部、市教育局和市文明办联合举行的读书征文比赛活动。该活动旨在倡导全民读书理念，通过品读文学名著、走近文学名家，培育文学新人，弘扬社会主义核心价值观，提高学生读写能力，繁荣校园文化。

- 绿书签：是以"4·26世界知识产权日"为契机，以特别设计制作的绿书签为载体，以"拒绝盗版，从我做起"为宣传口号，倡导公众尊重创意、支持正版，在全社会掀起营造繁荣健康有序文化市场环境热潮的年度主题行动。“绿书签”行动突出“扫黄打非”保护未成年人健康成长的工作宗旨，围绕“护苗”行动涉及的保护未成年人文化权益、净化网上网下文化环境、提升青少年网络素养、养成良好阅读习惯、树立保护知识产权理念等主题内容。