代账公司通常会使用员工身份证来进行相关的账务处理和登记工作，例如：

1. 开立公司账户：代账公司可能需要使用员工身份证来开立客户（即企业）的银行账户，以便进行资金管理和交易。

2. 纳税申报：在进行税务申报和缴纳税金时，代账公司可能需要提供员工身份证信息，以确保税务申报的准确性和合规性。

3. 社保和公积金登记：代账公司可能需要使用员工身份证来进行社保和公积金的登记和管理，确保员工的社保和公积金权益。

4. 个人所得税处理：针对员工的个人所得税，代账公司可能需要使用员工身份证信息进行相关的报税和申报工作。