工程联系单需要甲方盖章才能发生效力。因为工程联系单是一份重要的合同文件，需要双方的合法代表人签字并盖章确认。

甲方盖章代表着他们已经经过了内部审批程序，并且有足够的授权签署该文件。同时，盖章也表明甲方对合同的内容和条款做了充分的讨论和确认。因此，在签署工程联系单时，甲方的盖章是必不可少的。