《大义觉迷录》现存于世的主要版本有两种，一种是南宋理学家朱熹所著的《大学衍义》，另一种是明代儒学家王阳明所编的《大义觉迷录》。其中，《大义觉迷录》的原始版本已经失传，现存的版本均为后人据各种资料整理编辑而成。

较为完整的版本，有魏源所编的《大义觉迷录》、王文成所编的《觉迷录》、陈寅恪所编的《大义觉迷录校注》等版本。此外，还有不同版本的抄本和手抄本流传于世。