门源指的是浩门河之源，这里的浩门河就是大通河，门源县因此而得名。

浩门河源头水流叫加巴尕当曲，源于天峻县沙果林那穆吉林岭东端的扎来掌，流经木里盆地、江仓盆地、默勒盆地、门源盆地，在门源县克图以下逐渐转南东流，再转南流至民和县享堂与湟水汇合。