1、外观不同。河豚鱼体形圆鼓，下腹部呈白色并有气囊，且有小颗粒分布，遇危险时会吸气膨胀，背部为深色的花纹，颜色类型不一。鲃鱼体形偏长，背部微微隆起，颜色一般为青灰色，且有深色的斑纹分布。

2、生活环境不同。鲃鱼是一种淡水鱼，主要生活在江河、湖泊中，在河流石洞和石缝中活动较多。河豚鱼主要是生活在海中，但是会在近海口的淡水中产卵，因此也可在淡水中生存。

3、分布不同。河豚鱼的分布广泛，在中国沿海海岸均有分布，在临海的江河中也有分布。鲃鱼则主要集中于在海南、云南的一些江河中。