要设置北京公积金自动还款，首先需要登录北京住房公积金管理中心的官方网站或使用手机APP。然后，在个人账户中选择“自动还款”功能，并填写相关信息，如还款银行卡号、还款金额等。

确认无误后，提交申请并等待审核通过。一旦审核通过，系统将自动从指定银行卡中扣除相应金额，并按时还款。设置自动还款可以方便快捷地管理公积金账户，避免忘记还款或延迟还款的情况发生。