科三直行通过路口的正确步骤为：

首先，在路口前要减速，观察路口的交通信号灯、标志、路况及周围情况，确认路口安全后可以通过路口。

过程中，需要保持车速稳定，不得加速超速或突然刹车。

同时，要时刻注意前后左右的交通情况，特别是遇到慢速或倒车车辆要及时避让，保持安全距离。

最后，当车辆完全通过路口时再恢复正常行驶状态。