如果不动产权证登记证明单丢失了，首先需要尽快向当地的不动产登记机构报失，并申请重新办理证明单。在申请补办过程中，需要提供相关的身份证明和有关的不动产信息，以便机构能够核实身份和所有权信息。同时，需要缴纳相应的手续费，并按照机构的要求填写申请表格。

一旦重新办理完成，新的不动产权证登记证明单将被重新发放，确保您的不动产权益得到有效的保障。