初三体检通常需要进行全面的身体检查，其中包括生殖器等私密部位的检查。一般来说，体检时需要脱下裤子，穿着身体贴身的内衣，进行相关检查。这是为了确保能够全面检查身体的健康情况，了解各个部位的状况，是否存在问题。

同时，在进行体检时，医生会尽量保护隐私，提供必要的隐私保护措施，保证检查的隐私性和个人尊严。因此，学生不要担心，应该积极配合医生进行检查，确保身体的健康。