分子育种是一种现代的育种方法，通过将外来的基因或DNA分子片段，用人工的方法进行重组，然后通过一定的载体引入到“受体”生物的细胞内，从而改变后代生物的遗传信息，快速、稳定而定向地创造出新品种（或新物种）的现代育种方法。

分子育种的理论基础主要包括分子遗传学和基因工程技术。分子遗传学研究DNA或RNA分子的结构和功能，以及基因表达的调控机制。基因工程技术则是将外源基因导入到生物体内，并将其表达为蛋白质。

分子育种的方法主要包括基因组编辑、转基因技术、分子标记辅助选择等。基因组编辑是指通过CRISPR/Cas9等基因编辑技术，对DNA分子进行精确定位修饰，从而改变生物的遗传信息。转基因技术则是将外源基因导入到生物体内，并将其表达为蛋白质。分子标记辅助选择则是通过检测基因表达的变化，辅助选择优良个体。