敦煌开通11条航线，营运5家航空公司，可飞往北京、上海（虹桥机场）、广州、成都（天府机场）、西安、杭州、兰州、乌鲁木齐、西宁、花土沟。

敦煌机场还成为了重要的国际旅游支线机场，开通过飞往金边、釜山、大阪、香港等地的国际航线，也是亚欧航路的备降机场。