征信中心可以根据借贷合同记录以及银行等机构的信息核实，从而判断哪个款项没有还清。在借款人的征信报告中，会清晰地标注出每笔贷款的还款状态，如是否逾期、欠款金额等。

同时，征信中心还会根据公共数据和信用记录评估借款人的信用状况，从而提供更全面的信用评估报告。通过这些信息，征信中心能够准确了解借款人的还款情况，帮助金融机构做出更明智的贷款决策。