农村自建房的独立地基垫层使用砖头并不是推荐的做法。虽然砖头具有一定的承重能力，但相比混凝土等材料，其承重能力和稳定性较低。而且，砖头对湿度的敏感性较高，容易受到潮湿环境的影响而发生形变，从而影响地基的稳定性。

为了确保自建房的安全和稳定性，建议使用混凝土或其他更专业的材料来构建独立地基垫层。这样可以确保地基具有足够的承重能力和稳定性，同时能够抵抗潮湿等环境因素的影响。

总之，为了确保农村自建房的安全和稳定性，建议在地基垫层材料选择上慎重考虑，选择更专业、更合适的材料。