轨道灯二线和三线的区别在于电气接线的不同。

轨道灯二线是指灯具只有两根电气线，即一个接地线和一个电源线。在使用时，需要将灯具的地线和电源线分别接到相应的接地和电源线上。

而轨道灯三线则是指灯具有三根电气线，即一个接地线、一个零线和一个电源线。在使用时，灯具的地线接到接地线上，零线接到零线上，电源线接到电源线上。相较于二线，三线的漏电保护更加完善，灯具也更安全可靠。