荆州市中心医院现设有35个临床科室、8个医技科室、45个专业学组、14个临床研究室、1个临床研究中心。骨科、泌尿外科、血液内科、口腔科、检验医学部、普外科、妇产科、急诊医学科、麻醉科先后被评为省级临床重点专科,重点专科数量名列我市第一,全省前列。腔镜系列、急诊急救、心胸外科、肿瘤诊断等医疗技术在江汉平原享有盛誉。