企健卡在药店可以通过刷卡付款或使用企健卡号进行支付。只需在结账处将企健卡进行刷卡操作或输入企健卡号，即可完成支付。

员工有特殊医疗保险支付限额，超出限额部分由企健卡支付，就不需要自己再付钱了。