一般来说，工伤三个月后补开诊断证明是有效的。只要员工提供的材料有医院盖章，并且属于首次诊断的材料即可。具体的情况会根据具体的法律法规和公司政策而有所不同，建议咨询相关法律专业人士或者公司人事部门。