商转公需要付担保费是因为商业贷款和公积金贷款的性质不同所造成的。

商业贷款是银行信用资质的认定，而公积金贷款则是国家政策的安排，因此，商转公需要额外支付担保费作为政策规定的一种财政补偿。

此外，商转公贷款的风险较高，需要进行风险评估和合规审核，这些都需要一定的费用来进行，因此担保费也包含了这些成本。

除了担保费外，商转公还需要支付公积金中心的提取手续费、评估费用以及贷后管理费等。

虽然这些费用会增加贷款成本，但对于购房者而言，商转公的贷款利率相对较低，总体成本仍然比商业贷款低廉。