南通高铁站目前有两个，一个是南通站，位于南通市崇川区幸福街道，北大街最北段，另一个高铁站位于通州区平潮镇，此高铁站也叫南通西站。

南通站位于南通市港闸区永兴大道，为中国铁路上海局集团有限公司管辖的二等站，是宁启铁路的中间站。