是的，娃哈哈在北京有分公司。作为中国领先的饮料品牌之一，娃哈哈公司在北京地区设置了多个分支机构，包括销售、市场推广等部门。此外，在北京的超市、便利店和餐厅等各类零售渠道中，娃哈哈饮料的产品也得到了广泛的销售和认可。总之，娃哈哈在北京市场上的影响力越来越大，为广大消费者带来了更多可口的饮品选择。