小鲸鱼的食物选择相当丰富。除了常见的鱼食，它们还会捕食各种小型海洋生物，如浮游生物（如浮游虾、浮游鱼等）、底栖生物（如底栖虾、底栖鱼等）以及甲壳类动物（如螃蟹、龙虾等）。此外，有些鲸鱼种类还会吃乌贼和鳗鱼等。它们的食物链广泛，体现了鲸鱼作为海洋食物链顶端的地位。